В 2013 году Suzuki провела рестайлинг второго поколения Hayabusa. Главным нововведением стала тормозная система: вместо Tokico установили радиальные моноблочные суппорты Brembo с 4 поршнями, а диаметр передних дисков уменьшили с 320 до 310 мм. С 2013 года стала доступна опциональная ABS, а с 2014 года ABS вошла в стандартное оснащение.
Двигатель и ходовая часть остались без изменений: 1340 см³, 197 л.с., 155 Нм. Мотоцикл продолжал выпускаться до 2020 года с ежегодными обновлениями цветовых схем. В 2019-2020 годах модель продавалась только в Северной Америке и Австралии из-за ужесточения экологических норм в Европе.