В 1979 году Suzuki представила обновлённую версию FM50A с 2-ступенчатой автоматической трансмиссией. Вместо ножного переключения передач, как на базовой модели, новая трансмиссия использовала автоматическое центробежное сцепление башмачного типа. Мопед также получил ручной вспомогательный переключатель с режимами Low и High, который можно было использовать на стоянке или на ходу для преодоления крутых подъёмов.
Габариты модели изменились: длина увеличилась до 1 620 мм, ширина до 665 мм, высота до 930 мм. Высота по седлу поднялась до 700 мм. Сухой вес увеличился до 72 кг (в поздних версиях снижен до 68 кг). Двигатель остался прежним - 49 см³, 3,5 л.с.
Модификация FM50A выпускалась в нескольких подверсиях: FM50A-2 (1981), FM50-4 (1988), FM50AM (1991), FM50AP (1993) и FM50AR (1994). Поздние версии отличались незначительными изменениями в дизайне, цветовых схемах и электрике. Производство завершилось в 1995 году.