Второе поколение Suzuki FB50 (код рамы BA42A, с 2008 - BA43A) дебютировало в ноябре 2004 года как модель 2005 года. Мотоцикл получил новый двигатель A405 (позже A407) объёмом 49 см³, мощностью 4,4 л.с. (3,2 кВт) при 7000 об/мин и крутящим моментом 4,9 Н·м при 5500 об/мин.
Главные изменения: колёса уменьшились с 17 до 14 дюймов, передняя подвеска стала телескопической вместо bottom-link, обтекатели и щитки стали пластиковыми. Высота по седлу снизилась до 705 мм, сухой вес - 69 кг.
В 2008 году модель получила систему впрыска топлива (инжектор), что улучшило запуск и снизило расход. Расход топлива составил всего 0,94 л/100 км. Это было последнее обновление модели.
Выпускалось несколько версий: FB50 (стандарт, кикстартер, спицованные колёса), FB50D (электростартер), FB50L (усиленная, литые колёса), FB50P (для доставки газет, усиленная подвеска, большая корзина), FB50PH (с подогревом ручек), FB50X (полицейская версия).