Suzuki DR125SE - наиболее известная и массовая модификация модели, выпускавшаяся с 1994 по 2002 год. Главное отличие от предшественницы - наличие электрического стартера в дополнение к кикстартеру. Мотоцикл получил новую приборную панель и 12-вольтовое электрооборудование.
Двигатель - 4-тактный одноцилиндровый воздушного охлаждения объёмом 124 см³ (57 x 48,8 мм), степень сжатия 9,5:1. Мощность - 12 л.с. при 9500 об/мин, крутящий момент - 10 Нм при 8600 об/мин. Система питания - карбюратор Mikuni BST31. Коробка передач - 6-ступенчатая.
Рама - стальная трубчатая. Передняя подвеска - телескопическая вилка 35 мм с ходом 205 мм, задняя - маятник с моноамортизатором (ход 200 мм). Передний тормоз - дисковый 230 мм, задний - барабанный 130 мм. Сухой вес - 114 кг, снаряжённый - 127 кг. Ёмкость топливного бака - 13 л.
Модель выпускалась с ежегодными обновлениями цветовых схем и графики. Заводские коды: DR125SER (1994), DR125SES (1995), DR125SET (1996), DR125SEV (1997), DR125SEW (1998), DR125SEX (1999), DR125SEY (2000), DR125SEK1 (2001), DR125SEK2 (2002).