Второе поколение Suzuki DR-Z250 выпускалось с 2005 по 2008 год. Основные изменения коснулись эргономики - высота по седлу была снижена до 895 мм (против 900 мм у первой версии). Длина мотоцикла осталась прежней - 2150 мм, колёсная база - 1455 мм.
Двигатель и трансмиссия остались без изменений: 249 см³, 32 л.с. при 7000 об/мин, 19.1 Нм при 5500 об/мин. Карбюратор Mikuni TM28SS для большинства рынков и BSR32 для Калифорнии.
В 2006-2007 годах (модели K6/K7) были внесены незначительные изменения в электрическую часть и настройки подвески. Для австралийского рынка (E-24) предлагалась версия с увеличенной до 2230 мм длиной и сухим весом 118 кг.