В 2001 году Kawasaki W650 получила ряд обновлений, направленных на улучшение управляемости. Колёсная база была увеличена с 1450 до 1455 мм, общая длина - с 2185 до 2190 мм, след вырос с 105 до 108 мм. Передняя подвеска была доработана.
Двигатель остался прежним - 676 см³, 50 л.с. при 7000 об/мин, 56 Н·м при 5500 об/мин. Мотоцикл продолжал оснащаться двумя карбюраторами Keihin CVK34, 5-ступенчатой коробкой передач и цепным приводом. Кикстартер сохранился.
В 2004-2005 годах модель продавалась в основном на рынках Японии и Европы, поставки в США были прекращены после 2002 года.