Honda XR50R - внедорожная модификация, выпускавшаяся с 2000 по 2003 модельный год. Мотоцикл базировался на проверенном двигателе от легендарного Z50R. Главные особенности: простота управления, низкая посадка (550 мм) и малый вес (47 кг сухой массы). Двигатель - 49-кубовый воздушный 4-тактный одноцилиндровый SOHC с двумя клапанами, 13-миллиметровым карбюратором Keihin, CDI-зажиганием и кик-стартером. Коробка передач - 3-ступенчатая с автоматическим центробежным сцеплением сухого типа, что позволяло юным райдерам не думать о выжиме сцепления. Передаточные числа: 3.272 (1-я), 1.667 (2-я), 1.190 (3-я).
В 2001 году модель получила обновлённую графику в стиле команды Honda Racing. В 2003 году ход передней перевёрнутой вилки увеличили с 96 до 97 мм, а заднего моноамортизатора - с 70 до 71 мм. Дорожный просвет составлял 150 мм. Привод - цепь #420 (14T передняя звезда, 37T задняя). Сухой вес во всех версиях - 47 кг. Модель выпускалась только в красном цвете.