В 1996 году Honda провела значительную модернизацию ST1100. ABS-версии (ABS II) получили 43-мм телескопическую вилку (вместо 41 мм), улучшенный 40-амперный воздушный генератор и связанную тормозную систему LBS (Linked Braking System) с 3-поршневыми суппортами. Передняя шина на ABS II версиях была изменена с 110/80-18 на 120/70-18.
Панель приборов была изменена - указатели поворотов переместились из верхней части в отдельные секции слева и справа от спидометра и тахометра. Появились две кнопки под левым боковым обтекателем: одна для отключения индикатора неисправности ABS, вторая - для отключения TCS.
Модели без ABS продолжали выпускаться с 41-мм вилкой и 2-поршневыми суппортами, но также получили усиленный генератор. Производство гражданских версий завершилось в 2002 году, но полицейские модификации выпускались до 2003-2006 годов.