Первая версия Honda NX125 с индексом модели JD09 выпускалась с марта 1988 года для японского внутреннего рынка. Мотоцикл оснащался двигателем JD09E - 4-тактным одноцилиндровым воздушного охлаждения объемом 124 см³ с электростартером. Коробка передач - 5-ступенчатая механическая. Модель предлагалась только в белом цвете Ross White с синим седлом.
Отличительные особенности версии JD09: уменьшенный топливный бак 8.5 л, высота по седлу 820 мм, более легкий сухой вес 110 кг, колесная база 1325 мм. Шины - 2.75-21 передняя и 4.10-18 задняя. На японском рынке модель продавалась по цене 299 000 йен.
В 1993 году производство для внутреннего рынка было завершено в связи с переходом на новую модель XLR125R (JD16). Ранние выпуски имели проблемы с трещинами рамы, что было исправлено в ходе производства.