Honda CTX1300 Deluxe - флагманская модификация модели. В США Deluxe была доступна только в 2014 модельном году, в Канаде - до 2015, в Европе и некоторых азиатских странах - до 2016 года. Остатки на складах дилеров реализовывались вплоть до 2019 года.
Главные отличия от базовой версии: комбинированная тормозная система Combined ABS (стандарт), система контроля тяги TCS, Bluetooth-аудиосистема с двумя динамиками и управлением с псевдобака, самовыключающиеся поворотники, а также затемненные (черные) колеса и элементы рамы. Снаряжённая масса составляет 338 кг.
В остальном характеристики идентичны базовой версии: 1261-кубовый V4 мощностью 62 кВт (83 л.с.), 5-ступенчатая МКПП, карданный привод, стальная рама, 43-мм перевернутая вилка и два задних амортизатора. Высота по седлу - 735 мм, топливный бак - 19.5 л под седлом.