В 2019 году Honda провела серьёзное обновление CRF125F, главным изменением которого стал переход с карбюратора на систему впрыска топлива PGM-FI с 22-миллиметровым дросселем. Это значительно улучшило запуск двигателя в холодную погоду и на высоте, а также повысило топливную эффективность и снизило выбросы.
Помимо системы питания, мотоцикл получил увеличенный ход подвесок: передняя 31-миллиметровая вилка на стандартной версии - 150 мм (ранее 140 мм), на Big Wheel - 170 мм (ранее 150 мм). Задняя подвеска на стандартной версии - 140 мм (ранее 114 мм), на Big Wheel - 168 мм (ранее 150 мм). Высота седла стандартной версии выросла с 734 до 739 мм. Снаряжённая масса увеличилась на 1-2 кг из-за компонентов системы впрыска. Ёмкость топливного бака уменьшена с 4,2 до 3,8 л.
Внешне модель получила обновлённую графику в стиле гоночных CRF450R. Версии Big Wheel (CRF125FB) и стандартная (CRF125F) продолжают производиться параллельно. На рынке США базовая цена стандартной версии составляет около $3 499 - $3 599, Big Wheel - $3 899 - $3 999.