Финальная модификация Honda CRF100F выпускалась с 2012 по 2016 год. Основное отличие - использование метрической маркировки шин: 70/100-19 спереди и 90/100-16 сзади вместо дюймовых 2.50-19 и 3.00-16. Также в официальных спецификациях Honda для 2012 года указан увеличенный ход передней вилки - 5,9 дюйма (150 мм) вместо прежних 5,2 (132 мм).
Мотоцикл оснащался электростартером (наряду с кикстартером на ранних модельных годах). Топливный бак - 4,92 л, снаряжённая масса - около 77 кг.
В 2014 году компания Honda официально заменила CRF100F на модель CRF125F с увеличенным до 125 см³ двигателем, электростартером и передним дисковым тормозом. Однако выпуск CRF100F для некоторых рынков продолжался до 2016 года.