В 2024 году Honda представила обновленную версию CB650R, соответствующую нормам Euro 5+. Главное новшество - опциональная система E-Clutch (электронное сцепление), которая автоматически управляет сцеплением при трогании, остановке и переключении передач. При этом водитель может в любой момент взять управление сцеплением на себя, используя обычный рычаг.
Двигатель был доработан для соответствия Euro 5+: мощность немного снизилась до 94 л.с. (69 кВт) при 12000 об/мин, крутящий момент - 63 Н·м при 9500 об/мин. Были оптимизированы катализатор и система выпуска.
Приборная панель получила обновленный интерфейс с улучшенной читаемостью. Мотоцикл также получил новые цветовые схемы: Matte Deep Black, Pearl Deep Mud Gray, Candy Chromosphere Red и Matte Jeans Blue Metallic.
Система E-Clutch стала доступна как опция за дополнительную плату. Базовая версия с традиционным механическим сцеплением также осталась в продаже.