В 2014 году Yamaha представила третье поколение Mio - модель Mio M3 125. Главным изменением стал новый двигатель 124,8cc с технологией Blue Core, обеспечивающей высокую топливную эффективность за счет оптимизированного сгорания и снижения трения. Мощность составляет 9,5 л.с. при 8000 об/мин, крутящий момент - 9,6 Нм при 5500 об/мин.
В 2016 году вышла версия Mio Z с более широкими шинами (100/70-14 сзади вместо 90/80-14) и матовыми цветами кузова. В том же году появилась версия Mio M3 AKS SSS с системой бесключевого доступа (Advance Key System) и системой старт-стоп (Stop Start System).
В 2017 году представлена версия Mio S с элегантным дизайном, светодиодной оптикой и улучшенной эргономикой, ориентированная на женскую аудиторию.