Первое поколение Yamaha Flipper 50 (YH50) выпускалось с 1998 по 2002 год. Мопед оснащался двухтактным двигателем 49 см³ с воздушным охлаждением и карбюратором Gurtner PY-12. Заводские коды модели: 5FV (1998-1999), 5PF (2000-2001), 5JB (2002).
От более поздних версий отличается оформлением передней части, формой пластика и декалями. Техническая начинка оставалась неизменной на протяжении всего производства: автоматический вариатор CVT, электростартер и кикстартер, дисковый передний тормоз и барабанный задний.