В 2016 году Yamaha провела серьёзное обновление Zuma 125. Скутер получил полностью переработанный передний обвес: вместо двух круглых фар появилась одна фара с интегрированными лампами ближнего и дальнего света. Были обновлены боковые панели, появилась новая решётка радиатора (декоративная, так как двигатель оставался воздушным).
Главные технические изменения: задний барабанный тормоз уступил место дисковому диаметром 200 мм, передний диск увеличился с 220 до 245 мм. Диаметр передней вилки вырос с 27 до 33 мм. Колёсная база увеличилась до 1306 мм. Снаряжённая масса снизилась до 118,8 кг. Топливный бак был увеличен до 6,4 л, а его горловина переместилась на левую сторону переднего обтекателя.
Появилась цифровая LCD-приборная панель с индикатором уровня топлива. Подседельное отделение стало вместительнее. Двигатель остался прежним - 125 см³, воздушное охлаждение, SOHC, 4 клапана, впрыск топлива. Расход топлива улучшился до 103 миль на галлон (около 2,28 л/100 км).