Первое поколение Yamaha YZF600R Thundercat появилось в 1994 году и заложило основу всей линейки. Модель получила рядный 4-цилиндровый двигатель объёмом 599 см³ с жидкостным охлаждением и 16 клапанами, а также стальную раму Deltabox.
В этой версии ещё не было ряда доработок, появившихся позже, однако базовая конструкция - подвеска, тормоза и силовой агрегат - уже была сформирована и в дальнейшем менялась незначительно.