С 2002 года Yamaha YP125 Majesty получил модификацию с впрыском топлива (FI). Это позволило снизить выбросы и улучшить топливную экономичность. Расход топлива по каталогу составлял около 39 км/л.
В рамках этого поколения выделялась версия SDX (код 5CA8), которая оснащалась инжектором, иммобилайзером, шинами Dunlop, прозрачными поворотниками и изменённым задним фонарём. Выпуск модели завершился 1 августа 2008 года.