Yamaha XJ550 Seca - спортивная версия модели, представленная в 1981 году. Отличалась более высокими распредвалами (подъем впускных клапанов 7,8 мм, выпускных 7,1 мм) с фазами газораспределения 268/264 градуса, что обеспечивало пиковую мощность на высоких оборотах (красная зона 10 000 об/мин).
Мотоцикл оснащался баком объемом 15 литров, задним колесом 18 дюймов с шиной 110/90-18, передней шиной 3.25-19. Снаряженная масса составляла около 204 кг. Версия Seca была ориентирована на активную езду и отличалась более спортивной посадкой водителя.