С 2009 года Yamaha VP125 (X-City 125) получил важные обновления: четырёхпозиционное регулируемое по высоте ветровое стекло и базу для заднего топкейса (багажник). Эти улучшения повысили комфорт при дальних поездках и увеличили практичность скутера. Техническая начинка осталась прежней: двигатель Minarelli 124,7 см³ с жидкостным охлаждением, системой EFI и каталитическим нейтрализатором стандарта Euro 3, автоматическая CVT.
Регулируемое стекло особенно пригодилось высоким водителям (выше 185 см), позволяя снизить напор ветра на скоростях свыше 60 км/ч. База для багажника давала возможность установить фирменный топкейс Yamaha, увеличивающий полезный объём хранения. В остальном скутер полностью идентичен ранней версии: те же колёса 16/15 дюймов, дисковые тормоза 270/240 мм, колёсная база 1455 мм и снаряжённая масса 167 кг.