Первая модификация Yamaha TW125 выпускалась с 1999 по 2001 год с заводским кодом 5EK1/5EK2. Байк оснащался карбюратором TEIKEI Y24P/1, аккумулятором GM 7CZ-3D (12V 7AH) и галогеновой фарой 45/40 Вт. Ход передней подвески составлял 160 мм, угол наклона вилки - 26°, величина следа - 95 мм.
Габариты: длина 2140 мм, ширина 810 мм, высота 1120 мм. Высота по седлу - 805 мм, колесная база - 1330 мм, дорожный просвет - 260 мм. Снаряженная масса (с маслом и полным баком) - 125 кг.