Yamaha RZ125S выпускалась с 1983 по 1984 год и стала промежуточной модификацией между начальной версией и финальной YPVS. Главные отличия - увеличенная до 22 л.с. мощность (16,1 кВт при 9500 об/мин) и возросший до 16,7 Нм крутящий момент. Двигатель остался без системы YPVS, но благодаря настройке карбюратора и выпуска мощность выросла на 2 л.с.
Внешне мотоцикл отличался небольшим бикини-обтекателем вокруг фары, изменившим стиль и аэродинамику. Высота модели увеличилась до 1190 мм за счёт установки обтекателя. Сухой вес вырос всего на 1 кг (до 98 кг).
Шасси и ходовая часть остались без изменений: та же рама, подвеска Monocross, колёса 18 дюймов, передний тормоз - диск 245 мм, задний - барабан 130 мм. Розничная цена в Японии составляла 265 000 иен.