В 2013 году Yamaha FZ8-N получила долгожданное обновление. Главное изменение - появление полностью регулируемой передней вилки (отбой и сжатие на правой ноге, преднатяг пружины на левой). Задний амортизатор получил более жёсткую пружину (83,4 Н/м вместо 78,4) и регулировку отбоя. Настройки ЭБУ были изменены для более острого отклика на газ.
Внешне модель отличается новым глушителем (вместо прежнего "блина"), прозрачными указателями поворота и новой цветовой схемой Race Blu (гоночный синий). Доступны также цвета Midnight Black и Competition White. В США модель была снята с продаж после 2013 года, в Европе и Океании выпускалась до 2015 года.