В 2003 году Suzuki провела полное обновление SV650. Мотоцикл получил новую литую алюминиевую раму (pressure-cast), впрыск топлива SDTV вместо карбюраторов, новый дизайн в стиле SV1000 и цифровой спидометр. Мощность выросла до 72 л.с.
В 2004 году подрамник был опущен на 40 мм для удобства посадки. В 2005 году рама стала чёрной матовой, а радиатор уменьшился. В 2007 году появились двойные свечи зажигания на цилиндр и опциональная ABS. В 2008 году вышла версия SV650SF с полным обтекателем.