KTM 540 DXC - кроссовая версия модели 540, предназначенная для пустынных гонок и мотокросса. Выпускалась с 1994 по 1996 год. Отличалась от эндуро-версий усиленной подвеской, облегчённой конструкцией и отсутствием светотехники. Мотоцикл был ориентирован на участие в соревнованиях по кроссу и ралли-рейдам.
Двигатель - одноцилиндровый двухтактный объёмом 539 см³ с жидкостным охлаждением. Мощность - около 60 л.с. Коробка передач - 6-ступенчатая. Подвески WP были настроены на жёсткие условия пустынных гонок. Сухой вес составлял около 103 кг.