С 1993 года Honda Cub EZ90 получил обновлённую цветовую палитру. Из трёх начальных цветов остались только белый Shasta White и красный Fighting Red. Голубой Pure Flandre Blue был исключён из гаммы.
Главные визуальные отличия: синее седло уступило место красному, передние крылья и накладки руля также стали красными. Заднее крыло из белого превратилось в красное. Бело-красная расцветка стала визитной карточкой модели в её поздние годы.
Техническая начинка осталась без изменений: всё тот же двухтактный двигатель 90 см³ с вариатором, электростартёр, барабанные тормоза и закрытый цепной привод. В 1994, 1995 и 1996 годах значительных обновлений не производилось.
Производство завершилось в 1996 году. Всего за шесть лет было выпущено сравнительно небольшое количество машин, что делает модель редкой и желанной для коллекционеров. Серийные номера: JH2HE060*PK400002 (1993), JH2HE060*RK500001 - RK501008 (1994), JH2HE060*SK600504 (1995), JH2HE060*TK700001 (1996).