В 2017 году Honda провела серьёзное обновление CBR650F. Модель получила новый код RC96. Двигатель был доработан: мощность выросла до 90 л.с. (67 кВт) при 11000 об/мин, крутящий момент - до 64 Нм при 8000 об/мин. Это стало возможным благодаря новым распредвалам, увеличенной степени сжатия и оптимизированным впускным каналам.
Передняя вилка Showa SDBV (Separate Bore Dual Valve) с раздельными поршнями обеспечила улучшенное демпфирование. ABS стала стандартным оборудованием. Появилась полностью светодиодная оптика (фара, габариты, поворотники). Приборная панель получила обновлённый дизайн с улучшенной читаемостью.
Передаточные числа коробки передач были изменены для лучшей динамики. Мотоцикл соответствовал нормам Euro 4. Снаряжённая масса незначительно выросла до 213 кг из-за дополнительного оборудования.