В 2001 году Yamaha выпустила обновлённую версию Spy 50. Мопед получил изменённый дизайн пластикового обвеса, обновлённую приборную панель и некоторые доработки двигателя. Техническая основа осталась прежней - двухтактный двигатель 49 см³ воздушного охлаждения, вариаторная трансмиссия, барабанные тормоза.
Мопед сохранил стальную раму, 12-дюймовые колёса и телескопическую переднюю вилку. Производство модели было завершено в 2002 году.
В 2001 году Yamaha Spy 50 получил небольшое обновление. Изменения коснулись в первую очередь внешнего вида - был обновлён пластиковый обвес и приборная панель. Технические характеристики остались практически без изменений.
Эта версия выпускалась до 2002 года включительно, после чего производство модели было прекращено. Сегодня Yamaha Spy 50 2001-2002 годов - редкая находка для коллекционеров и любителей малокубатурной техники. Запчасти для этой модели, особенно пластик, пользуются спросом на вторичном рынке.
