В 2018 году Yamaha представила обновленную версию Aerox 4 50, которая выпускалась до 2021 года. Модель получила незначительные изменения в настройках двигателя - на некоторых рынках мощность указывалась как 2.95 л.с. (2.2 кВт) при 7250 об/мин, на других - 3.45 л.с. при 7000 об/мин.
Цветовая гамма обновилась: появились цвета Matte Grey и Yamaha Blue. Модель полностью соответствовала нормам Euro 4. Конструкция шасси, подвески и тормозов осталась без изменений.
В 2021 году производство модели было завершено. На смену Aerox 4 50 в Европе пришли другие модели, соответствующие более строгим экологическим нормам.