Модификация TRX650FGA (также известная как TRX650GPS или GPScape) появилась в 2004 году и отличалась от базовой версии наличием встроенного GPS-навигатора, интегрированного в приборную панель. Это было инновационное решение для своего времени - GPS позволял сохранять до 100 путевых точек, отображал направление движения (цифровой компас) и имел автоматическую компенсацию времени.
По остальным характеристикам версия GPScape полностью идентична базовой TRX650FA: тот же 649-кубовый двигатель, трансмиссия Hondamatic, подвеска и тормозная система. Цветовая гамма включала красный и оливковый цвета.