2016 год стал последним для Yamaha Majesty S 125. Модель завершила свой жизненный цикл без каких-либо технических изменений. Скутер сохранил все характеристики предыдущих лет: 125-кубовый двигатель мощностью 12 л.с., вариатор, дисковые тормоза и 13-дюймовые колёса.
После 2016 года модель была снята с производства, уступив место другим городским скутерам в линейке Yamaha, таким как NMAX 125 и XMAX 125.