В 1987 году Yamaha провела серьёзное обновление модели T80. Модернизация затронула двигатель: были изменены фазы газораспределения и зазоры клапанов, добавлена система YICS (Yamaha Induction Control System) для улучшения наполнения цилиндра и снижения расхода топлива. Трансмиссия стала исключительно 4-ступенчатой. Крышка бензобака получила замок.
Модель выпускалась в двух исполнениях: T80D (код 2MK) - с кикстартером и 6-вольтовой электрикой, и T80ED (код 2ML) - с электростартером в дополнение к кикстартеру и 12-вольтовой бортовой сетью. T80ED имел сухой вес около 80 кг против 77 кг у базовой версии.
Внешние изменения включали новую переднюю оптику и приборную панель. В таком виде модель выпускалась до 1995 года без существенных изменений.