Третье поколение Yamaha PW80 выпускалось с 2002 по 2006 год. В 2005 году компания Yamaha официально анонсировала выпуск модели 2006 года с обновлённой графикой в стиле кроссовых мотоциклов YZ. Цвет - Deep Purplish Blue Solid E (синий с белым). Для рынка США это поколение стало последним - производство PW80 в США завершилось в 2006 году.
Мотоцикл сохранил все ключевые особенности: 79-кубовый двухтактный двигатель с системой Autolube, 3-ступенчатую коробку передач с автоматическим центробежным сцеплением, телескопическую вилку спереди и маятник с моноамортизатором сзади. Барабанные тормоза спереди (95 мм) и сзади (110 мм). Колёса - спицованные, резина - 2.50-14 спереди и 3.00-12 сзади.