С 2005-2006 годов квадроцикл Arctic Cat ATV 650 перешёл на собственный одноцилиндровый двигатель H1 объёмом 641 см³ с четырьмя клапанами и системой SOHC. По сравнению с прежним V-образным мотором новый агрегат отличался более высоким крутящим моментом на низких оборотах, что улучшило тяговые характеристики при буксировке и езде по грязи.
Трансмиссия осталась автоматической (Duramatic) с системой торможения двигателем (EBS), а привод переключался между 2WD и 4WD электрической кнопкой с отдельным рычагом блокировки переднего дифференциала. Дорожный просвет увеличился до 305-317 мм в зависимости от версии. В рамках линейки предлагались комплектации SE с улучшенной отделкой и TBX с усиленной грузовой платформой.